Yammer se organiza en gran medida mediante grupos. El grupo Toda la compañía es el grupo predeterminado en el que todos los usuarios pueden publicar. Un grupo puede estar dedicado a un tema, un grupo, un departamento o un proyecto en concreto. Los grupos son una excelente forma de llevar a cabo el trabajo en un equipo y de mantenerse informado sobre un tema. La mayoría de los grupos son públicos y es fácil unirse a ellos, pero otros son privados y es necesaria una aprobación.

En un grupo puede responder a un mensaje para continuar con el diálogo, proporcionar información útil o una perspectiva concreta, plantear preguntas, proporcionar respuestas y resaltar los procedimientos adecuados para que otras personas lo puedan ver. Publique un mensaje con el que esté compartiendo algo útil, interesante y que desencadene una conversación. Responder y publicar también incentiva a sus compañeros de trabajo a hacer contribuciones. Por último, avance rápidamente a través de las actualizaciones del grupo utilizando los indicadores numéricos y el símbolo siguiente del grupo.